Otprilike od kraja 19. stoljeća znanstvenici su počeli gomilati znanje o razlikama između pro- i eukariotskih stanica, te su tako postupno izolirali zasebno kraljevstvo mikroorganizama, ujedinjeno nedostatkom stanične diferencijacije, - Protista. Međutim, što su bakterije, u to su vrijeme morali samo proučiti: tek u 20. stoljeću. ovo znanje je sistematizirano.
Bakterije se nalaze u svim sredinama gdje se organska tvar može akumulirati. Podnose visoke i niske temperature, slanost i kiselost. Dakle, kraljevstvo bakterija ne živi samo u okolišu, gdje razgrađuju organsku tvar za svoju životnu aktivnost, već i gusto naseljava mnoge sluznice životinja i ljudi, pomažući u probavi hrane i natječući se s patogenim mikroorganizmima. Njihova je uloga u metabolizmu dušika posebno velika, budući da su samo cijanobakterije sposobne prerađivati atmosferski dušik. Međutim, neke bakterije su uzročnici bolesti: kuge, anaerobnih i crijevnih infekcija, sifilisa, kolere i antraksa.
Morfologija
Ultrastruktura bakterija može se vidjeti samo elektronskim mikroskopom, ali što su bakterije i kako izgledaju izvana može se vidjeti i imerzijskom mikroskopijom pomoću posebnih tehnika bojenja. Veličine ovih mikroorganizama variraju od 0,1 do 10 mikrona, ali morfologija bakterija omogućuje nam da ih podijelimo u 3 glavne skupine: sferne - koke (mono-, diplo-, tetra-, streptokoke i sarcine), štapićaste - bacili (mono-, diplo-, strepto-) i uvijene - vibrije, spirile i spirohete. U laboratorijskim uvjetima, radi određivanja vrste i enzimskih svojstava, uzgajaju se na jednostavnim ili posebnim hranjivim podlogama formiranjem kolonija, a u različitim podlogama imaju različit obrazac rasta.
Zgrada
Općenito, ono što su bakterije određuje njihova ultrastruktura. Izvana su bakterije zaštićene staničnom stijenkom koja se sastoji od slojeva peptidoglikana, lipida i teihoične kiseline. Koncentracija prvih određuje sposobnost bakterija da se boje prema Gram metodi u razmazu, prema kojoj se razvrstavaju u Gr + i Gr-. Neki od njih imaju dodatnu zaštitnu strukturu - kapsulu koja sadrži K-antigen i sprječava njihovu fagocitozu unutar makroorganizma, djelovanje toksičnih i mehaničkih čimbenika. Da biste saznali više o tome što su bakterije, morate proučiti njihovu unutarstaničnu strukturu: bakterije su ispunjene citoplazmom, u kojoj su otopljene druge organele (ribosomi, kromatofore) i hranjive inkluzije (lipidi, šećeri). Oni su kaoa svi prokarioti nemaju formaliziranu jezgru, a sve genetske informacije pohranjene su u dvolančanoj molekuli nukleinske kiseline koja se nalazi u nukleoidnoj zoni i fiksirana za membranu u jednoj točki. Izvan njega, genetske informacije sadržane su u plazmidima koji mogu odrediti razvoj patogenih svojstava i čimbenika. Za kretanje koriste flagele i spirile, fiksirane u stanici bazalnim tijelom, a njihova reprodukcija se događa dijeljenjem na dva dijela.
